يعتبر مستشفى القوات المسلحة بالجنوب صرحاً طبياً يقدم الخدمات الطبية والصحية (العلاجية , الوقائية , التشخيصية) في كافة التخصصات الطبية لمنسوبي وزارة الدفاع بالمنطقة الجنوبية ، إضافة إلى كونه مستشفى مرجعي يستقبل الحالات الحرجة المحولة من قبل المستشفيات العسكرية من شرورة ، نجران ، جازان ، وكذلك استقبال الحالات المحولة من المستشفيات المدنية بالمنطقة ، وتقديم خدمات جراحة القلب المفتوح ، وزراعة الكلى وجميع التخصصات الطبية الدقيقة الأخرى الغير متوفرة بمستشفيات المنطقة الجنوبية.

وانطلاقاً من هذا الهدف السامي تم افتتاح أول مستشفى للقوات المسلحة في المنطقة الجنوبية بمدينة خميس مشيط عام 1384هـ الموافق (1964م).

افتتح بعد ذلك مستشفى الملك فيصل العسكري ضمن منشآت مدينة الملك فيصل العسكرية برعاية كريمة في وقتها من الملك فيصل بن عبدالعزيز آل سعود (طيب الله ثراه) وذلك في عام 1395هـ الموافق (1975م) بسعة (108) سريراً ، ونظراً للحاجة الماسة لافتتاح مستشفى آخر لاستيعاب الازدياد المضطرد للمراجعين والتوسع والتنامي الكبير الذي تشهده المنطقة لمنسوبي القوات المسلحة فقد تم لاحقاً عام 1402هـ الموافق (1982م) افتتاح مستشفى القوات المسلحة بالجنوب بسعة (205) سريراً وعلى مدار السنوات الماضية شهد المستشفى منذ نشأته وحتى تاريخه العديد من التطويرات ومنها ما يلـي:

وعلى مدار أربعة عقود مضت تم تطوير وتوسعة مرافق المستشفيين ليصبح اليوم صرحاً طبياً متكاملاً في المنطقة الجنوبية ، حيث تم رفع السعة السريرية لتصبح (571) سريراً ، ومن المستهدف خلال المستقبل القريب بأن يصبح المستشفى مدينة طبية متكاملة المراكز والتخصصات.